KKNT Proyek Independen adalah program KKN tematik yang memberikan kesempatan kepada mahasiswa secara individual atau kelompok untuk mengembangkan sebuah proyek berdasarkan topik sosial tertentu, baik yang telah dirintis maupun baru yang dilaksanakan di daerah bukan lokasi KKN yang ditetapkan Unesa, misalnya (a) mengembangkan bantuan belajar untuk anak-anak berkebutuhan khusus, (b) mengembangkan proyek usaha ekonomi untuk anak di terminal/stasiun, (c) mengembangkan proyek edukasi kesehatan untuk lingkungan komunitas pemulung/anak jalanan, dll.