Mata kuliah Mikrobiologi Peternakan membahas konsep dasar mikroorganisme serta peran dan aplikasinya dalam bidang peternakan, meliputi struktur, fisiologi, pertumbuhan, metabolisme, klasifikasi, dan teknik dasar mikrobiologi. Materi mencakup mikrobiota saluran pencernaan ternak, mikrobiologi rumen, fermentasi pakan, pemanfaatan probiotik, prebiotik, sinbiotik, dan bioteknologi mikroba, serta mikroorganisme patogen, penyakit zoonosis, keamanan pangan asal hewan, higiene, sanitasi, biosecurity, dan pengendalian mikroorganisme. Selain itu, dibahas pemanfaatan mikroorganisme dalam pengolahan limbah peternakan, produksi bahan biologis, serta perkembangan teknologi mikrobiologi modern untuk mendukung kesehatan ternak, produktivitas, keamanan pangan, dan peternakan berkelanjutan.