Matakuliah Ekologi Laut mempelajari ruang lingkup dan perkembangan ekologi laut meliputi; karakteristik ekosistem laut, zonasi lautan, interaksi antara faktor biotik dan abiotik pada ekosistem lautan, aliran energi dan daur materi pada ekosistem laut, struktur komunitas lautan, dinamika populasi organisme laut, interaksi manusia dengan lautan serta problematika dalam pemanfaatan sumberdaya kelautan dan upaya pelestariannya. Produk atau luaran dari mata kuliah ekologi laut adalah laporan praktikum ekologi laut. Penyajian kuliah dilaksanakan dalam bentuk kajian teoretis, presentasi, diskusi, dan praktikum di lapangan dan di laboratorium.